10/26/2007

[NMRPipe] ダウンロード

時間が無いといいながらも、早速、第一歩。ちなみに、ここからは、すべて、OSX(インストール時点で10.4.10)上での話です。Linuxの人は読み替えてください。ただ、Linux固有の必須事項もあるので、その場合はその都度、ドキュメントを参照してください。

あと、お決まりですが、失敗してデータが飛んだり、OSが起動しなくなっても、わたしゃ知りません。ご自分の責任でおこなってくださいね。


さて、
NMRPipeを取得しましょう。

まずはここ
一番上に、
How to get NMRPipe and Related Software: Don't hesitate!

とありますね。メールしましょう。メールアドレスは、その段落の中にあります。ここには明記しません。
メールの内容ですが、

  1. 名前、
  2. 所属研究室、
  3. どのプログラムを取得したいのか(NMRPipeと書いておけば問題ありません)

を最低、明記しましょう。
また、あなたの研究内容も書いてくれたらうれしいなと書いてありますね。

さて、メールをしたら、待ちましょう。先方も忙しい方です。私がメールしたときは、学会で長期不在のため、返事が来るまでしばらくかかりました。

さ、返事が来たら、そのメール内に、
ダウンロード先、
ユーザー名とパスワードが書かれていると思います。ざっくりダウンロードしてください。

で、どれをダウンロードすればいいの?

  1. install.com
  2. binval.com

  3. INSTALL
  4. DESCRIPTION
  5. README
  6. RECENT

  7. nmrpipe.*.tar.Z (as appropriate for your system)

  8. dyn.tar.Z (recommended, DYNAMO structure calculation)
  9. mfr.tar.Z (optional, NMR Homology, Dipolar Coupling tools; requires DYNAMO)
  10. pdbH.tar.Z (PDB Database, required for MFR and DYNAMO)

  11. NMRPipe.tar (All-inclusive archive, takes the place of 3-10 above.)

最低限、1、2、7です。3、4、5、6はドキュメントなので、プログラムの実行には必要ありませんが、大事なことがかいてあるので、落としておきましょう。

で、7は、どれを落とせばいいかわからないなら、11を落としておきましょう。3から10まで全部含まれています。8、9、10はオプションです。私の使用する範囲では必要ないので落とすだけ落として使っていません。

今日はここまで。

予告 NMRPipe

フリーのNMRソフト、NMRPipe。

Linux版、OSX版等、*nix系で動作する非常に優れたソフト。

このソフトの、取得(ダウンロード)、インストール、実行までを、もちろん、日本語でのせて行きます。(このソフトが必要な人は英語が読めるはずだよね。でも、やっぱり、日本語があった方が便利だよね。)

今はテンパってるので時間ができてから。

10/21/2007

pdf ファイルをOSXのFirefoxで開く?

OSXで、pdfファイルをブラウザ内で開く方法を調べてみた。

 Safariでは、
PDF Browser Pluginなるもので開くようになる。
もしくは、
adobe reader 8.1 (今現在の最新版)を使えば、PDF Browser Plugin を使わなくても、Safari内にAdobe Readerを介してブラウザ内に表示される。

Firefoxの場合、
これがだな、びみょう〜〜。
PPCの人なら、
PDF Browser Pluginなるもので開くようになる(らしい)。

が、残念ながら、
Intelのひと、あきらめてください。PDF Browser PluginはIntelでは動かない模様。

Adobeさん、次期Readerでは、Intel上でもFirefoxにPluginしてください。